12月24日下午，学校召开“985工程” 二期验收总结工作布置会。郑南宁校长出席会议，校长助理宋晓平对验收和总结工作作具体安排，各学院、项目建设单位和有关职能部门的负责人参加会议。
根据教育部、财政部“985工程”办公室《关于做好“985工程”二期验收等有关工作的通知》的部署，国家将在2009年上半年对“985工程”二期建设进行验收，同时全面总结“985工程”十年建设成效，研究制订“985工程”三期建设规划。文件明确指出“985工程”二期验收工作是整个建设过程中的一个重要环节，“985工程”已有建设成效将作为“985工程”三期建设投入的重要依据，因此学校要求各院（部）、处及项目建设单位应高度重视，围绕国家的任务部署，周密安排，认真、系统、全面的准备校内“985工程”二期验收和学校的“985工程”十年建设成效总结，为继续实施“985工程”三期奠定坚实的基础。
宋晓平助理具体安排了我校“985工程”二期验收、十年建设成效总结及三期建设规划工作，明确了各单位的分工与职责。
郑南宁校长要求职能部门在“985工程”二期验收总结工作中发挥服务基层作用，减轻基层负担，例如由职能部门统计和公布相关数据，方便学院和教师查询使用。
谈到“985工程”三期建设的基本思路时，郑校长指出我校“985工程”三期的基本原则和出发点与一期、二期相比有所不同，学校将进一步加大有特色学科的建设力度。通过“985工程”三期，加强一些重要的、有战略性的、基础性的实验环境建设。学校还将加强投入，在严格论证的前提下，可增加投入，不设上限。郑校长希望在“985工程”二期的基础上，认真听取学科带头人和学院的意见，抓住机遇，在下一个五年中争取更大的成绩。
会上，郑校长谈了近期学校科研体制改革和管理队伍建设的一些重要举措。为适应国家科研经费改革大的变化，我校开展科研体制改革，通过机制创新，极大地推动学校科研工作发展。郑校长指出，我校通过国家重大专项聘用科研专职人员的做法，与温家宝总理在北航视察时所提出的“科研院所和学校重大科技专项以多种方式吸收大学生”的指导思想不谋而合，具体操作的关键是要出台政策和操作程序，学科教授要有积极性，以及如何解决与学科建设的结合问题。这样一批优秀的硕士生、博士生将成为学校科研队伍的新生力量，在新的机制下发挥作用。
